Многопрофильное лечебное учреждение на 280 мест. Больница внесена в реестр медицинских учреждений, осуществляющих деятельность в сфере обязательного медицинского страхования граждан РФ, и участвует в реализации Московской городской программы ОМС и Московской области. В Больнице бесплатно лечатся люди из всех регионов России вне зависимости от вероисповедания.
В 1992 году постановлением Правительства Больница была преобразована в Центральную клиническую больницу Святителя Алексия Митрополита Московского Московской Патриархии Русской Православной Церкви.
Стационарная служба представлена многопрофильным хирургическим стационаром, отделениями травматологии и ортопедии, неврологии, терапии и 2 отделениями паллиативной помощи. На базе хирургического отделения функционирует 6 специализированных Центров: Центр герниологии и абдоминальной хирургии, Центр гинекологии, Центр колопроктологии, Центр офтальмологии, Центр сосудистой хирургии и Центр урологии.
Больница Святителя Алексия является авторитетным научным центром. Здесь базируются 4 клинические кафедры: кафедра хирургических болезней и кафедра неврологии Российского государственного медицинского университета им. Н.И.Пирогова, кафедра травматологии, ортопедии и медицины катастроф Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, кафедра клинической физиологии и функциональной диагностики Российской медицинской академии последипломного образования.
Больница является базой для Свято-Димитриевского училища сестер милосердия Департамента здравоохранения города Москвы.